随着国民党顽固派反共的加剧和时局的逆转，中共中央指示全党采取“有理、有利、有节”的策略原则，反对顽固派的进攻。年7月7日，中共中央书记处发出《中央关于目前形势与党的政策的决定》，指出：“在国民党统治区的党，必须坚决执行党的组织上的隐蔽政策和精干政策，而对党外则执行广泛的统一战线的政策，以便揭穿和孤立顽固派和投降派。”东南局同年10月的指示，对浙江的形势和今后的工作作了分析后指出，新四军北移后，浙江党组织“要提高最高度的警惕性，注意反共的演变，要把我们的工作放在最坏的形势下去估计和布置，以达到保存实力与储藏我们的力量”10月底，省委书记刘英给浙南特委的信指出：时局逆转，整个局势将会更加严竣。并附来党中央和东南局的上述指示，要求浙南立即贯彻执行。从此，永嘉县委遵照中央、东南局以及省委的指示，转入隐蔽精干斗争时期。
贯彻执行隐蔽精干政策，党的斗争策略和组织形式需要重大转变，涉及党的工作的各个方面。为此，特委先后举办两期干部训练班，学习与贯彻隐蔽精干政策，以统一县区干部的思想。自国民党顽固派发动武装“清乡”之后，浙南党内产生了急躁情绪，部分干部党员要求调往抗日前线杀敌，通过学习，端正了态度，为长期坚持浙南基本地区斗争打下了思想基础。
浙南形势的发展，证明党中央和东南局的指示是及时正确的。年12月，国民党在龙泉成立了“闽浙赣三省边区绥靖指挥部”，下设5个绥靖分区，辖40多个县。这次“清剿”到年7月日军第二次侵占温州时才告一段落。在这次国民党顽固派“清剿”中，基本地区的党组织和人民生命财产遭受巨大损失。
年1月，国民党顽固派制造了震惊中外的“皖南事变”，掀起第二次反共高潮。4月，省委机关从丽水迁回温州城区。5月，中共中央决定将东南局与中原局合并成立华中局，任命刘英为华中局委员。7月，又任命刘英为华中局特派员，负责指挥浙江、福建、江西三地区工作。刘英准备将省委机关迁到闽、浙、赣3省交界的福建浦城，但未及行动，就被叛徒出卖。2月8日晚，刘英到温州恒丰盐店准备参加会议时，被埋伏在附近的叛徒、特务逮捕。接着，省委秘书周义群被捕叛变，出卖了他所知道的省委在温州城区的秘密联络点。从8日晚7时开始至9日7时结束，省委设在温州城区的7个秘密联络点均遭破坏，共计被捕8人，省委机关被彻底破坏。这起事件史称“温州事件”，是国民党顽固派在浙江蓄意制造的一起最严重的反共事件。5月18日，刘英在永康方岩被杀害。刘英的牺牲是浙江党和革命事业的重大损失。
年2月下旬，龙跃在瑞安梅山主持召开有特委常委郑丹甫（上次被捕后越狱回来浙南）、郑海啸和统战部长吴毓等人参加的紧急会议，研究省委机关被破坏的严竣形势下，如何坚持斗争的问题。经过激烈争论与反复权衡利弊，最后统一认识，决定继续坚持农村革命阵地。紧急会议后，分头到各地贯彻，落实会议精神，加强对各县的指导。为了适应斗争的需要，特委决定将永嘉县的瓯江以北部分（即今永嘉县辖区）划出，单独成立瓯北县委。
3月，中共瓯北县委在永嘉苍坡村成立，书记胡景瑊，组织部长徐顺性，宣传部长徐寿考。县委机关先后驻岭外、南岙、上泛、屿北等地。中共瓯北县委领导五个地区的党组织，有的地区实行委员会制，有的地区实行特派员制。岩头区委书记徐寿考，枫林区委书记徐顺性（后金强），沙头地区特派员郑九芝（陈胜筹），碧莲地区特派员关榕，五尺直属区特派员胡国洲。瓯江以南部分（即今鹿城、瓯海、龙湾区）仍归永嘉县委领导。成立浙南特委驻纸山办事处，由吴毓、孙经邃负责，指导永嘉、瑞安和瓯北县委的工作。
浙江省委被破坏后，华中局于年5月经过福建省委给浙南发来指示信，要求党组织在执行隐蔽精干、长期埋伏、积蓄力量，以待时机的方针下，应采取的具体措施是：党的武装基本上采取隐蔽与避免和国民党接触的方针，一般不同国民党作武装斗争；党的组织应当根据隐蔽精干原则加以整理与改造；党员和群众可以假自新，但绝对不准破坏机关和出卖人员；开办各种训练班，培养干部和革命知识分子。根据华中局等指示精神，年10月，县委举办区级骨干训练班，时间一个多月，谢用佐、谢用宣、谢用兴、潘志坚等十多人参加学习。年12月，县委决定建立武工队，姚玉山为队长（后潘统镛），县委组织部长徐顺性兼任指导员。年1月，县委把从城区撤退到西楠溪的陈玉华、邵静亚、朱月聪、林月霞、关少娴等十多位党员集中起来就训，时间也是一个多月。因为形势紧张，两期训练班都在五尺前山一带流动进行。
年11月10日，浙南特委根据中共中央、华中局的多次指示，发出《关于当前浙南党的中心任务的指示》，指示全面总结了两年来执行隐蔽精干政策的经验教训，还规定了“发展进步势力，争取中间势力，打击顽固势力”等方针的政策界限。根据华中局和特委的指示精神，为了加强对瓯北和乐清（含玉环）两县党的领导，年3月，中共浙南特委决定成立江北办事处（又称括苍办事处），主任吴毓（又名吴祖育），指导瓯北、乐清（含玉环）两县党的工作。办事处机关驻永嘉岭外村，后驻中堡村。
吴毓到江北办事处后，根据当地情况，做好了国民党永嘉县岩头区长、表山乡长等地方实力派和开明士绅胡卜熊的统战工作，同时派党员或可靠关系人充当保甲长。国民党永嘉县政府密令逮捕胡国洲、郑九芝等人，图谋破坏中共瓯北县委机关。由于得到国民党岩头区长的及时通知，得以安全脱险。8月，中共浙南特委江北办事处在蓬溪村牛栏塘召开瓯北、乐清两县党的领导人及军事干部会议，传达贯彻特委“隐蔽精干”会议精神。会议由吴毓主持，胡景瑊、邱清华、周丕振、徐顺性、徐寿考、仇雪清等参加会议。
年下半年，中共瓯北县委机关移驻屿北村，以屿北村为中心开展全县党的工作。此时，全县已建立党支部60多个，发展党员多人。党的活动不仅在广大农村，而且也延伸到集镇。县委“还注意加强中、小学校的工作，占领一些教育阵地，以公开职业为掩护进行党和群众的工作，起到积蓄革命力量的作用。”在西楠溪的瓯北中学、济时中学建立了党支部，数十所小学里均有转移过来的中共党员在其中担任教师。年10月，国民党第三战区司令部在福建浦城重建“闽浙赣三省边区绥靖指挥部”，下设三个区指挥部和16个督剿处。其中第三区指挥部下辖永嘉、瑞安、平阳、乐清、泰顺、玉环、丽水、青田、缙云、云和、景宁、福鼎和寿宁等县，在永嘉枫林设立第十四督剿处，国民党新编20师补充团上校团长曹集云为指挥官。曹集云军事、政治双管齐下，组织“肃奸队”，利用陈家璧、范亦辰等叛徒破坏党组织，七区（沙头）党组织被破坏殆尽，“肃奸队”的魔爪伸展到八区（枫林）、九区（岩头）、十区（碧莲）。
11月20日，中共浙南特委江北办事处主任吴毓，就如何反对曹集云“清乡”，贯彻“隐蔽精干”方针，拟好一份文稿给徐寿考，要他记熟、背诵、默写，然后派他到浙东，通过浙东区党委请示华中局。徐寿考到浙东后，默写出文稿的内容交给浙东区党委宣传部长顾德欢。由于浙东和华中局电报往返费时，徐寿考在浙东逗留了一个多月。徐寿考从浙东带来三条指示：
一、继续执行隐蔽精干政策。依靠党支部，依靠群众，依靠山区，依靠武装，保护干部，等待时机，配合全国作战。
二、在当地不能立足的共产党员和赤色群众，可以转移到浙东。
三、经费困难，由浙东帮助解决。
根据指示，年2月至4月，胡国洲、郑中卿、郑九芝、金昌帮、谢纯法等多人分批转移到四明山浙东抗日根据地。
国民党在枫林设立第十四督剿处后，吴毓即在谷庄村召集永乐两县党的负责人胡景瑊、邱清华等人，交换对时局的看法，并部署巩固地区工作。年11月，中共瓯北县委发表具名文章《为反对永嘉政府当局滥捕良民扰乱地方进行反共制造内战告西楠溪各界人士书》，揭露国民党顽固派反共反人民的罪行。文中指出：抗战六年来，人民在无衣无食的痛苦生活中，仍出钱出力坚持抗战，无论是谁都热烈希望早日打败日本侵略者，使大家过太平的日子。中国要赶走日本，谁都知道必须国内团结、上下齐心、一致把枪口对准敌人，否则，枪口对内打自己人，不但不能打败日本，恰恰正好帮助日本侵略者灭亡中国。中国应该加强内部团结，积极准备配合友邦向日本侵略者反攻。共产党人是这样主张的，民众也无不是如此主张的，可是国民党政府当局竟昧着良心，公然放着日本侵略者不打，反掉过头来打共产党，这真是祸国殃民的滔天罪恶。
曹集云“清剿”的重点是岭头、屿北、蓬溪等地。11月23日，曹集云率领多顽军分三路向小陈地区发起武装攻击。枪声一响，周围的半山、大岭头、岭头、中堡、五里等地武装民兵闻讯立即前来支援，人数众多，声势浩大，形成反包围的态势，至下午，曹集云不支败退。年冬，为了更有效地粉碎曹集云的“清剿”计划，吴毓决定在永（嘉）仙（居）黄（岩）边的黄山村一带开辟新的根据地，建立新的隐蔽点。因为黄山村一带山深林密，人烟稀少，交通不便，国民党的势力难以顾及。这一带盘踞着好几股武装土匪，要进去，首先要与那些武装土匪打交道，否则难以入门。
黄山地区的主要土匪头子是余汝苟，仙居吴山后人。此人原来是仙居十三都的土匪，年9月参加过武装暴动，失败后继续为匪，逃来永嘉。他手下有十多名匪徒，其中有仙居人，也有黄山村附近地方的永嘉人。他们有十发木壳枪一支，步枪五支，经常流窜于仙居、永嘉、黄岩边境的三角地带，抢劫货物或抓人敲诈勒索。
年11月间，吴毓先派郑九芝等人去黄山村，做他们的思想工作，希望他们不要劫掠人民的财产，要同国民党斗争。当时余汝苟等权衡利弊，表示同意共同反“清剿”对付国民党顽固派，并约好时间、地点，请地下党领导人前去会面、洽谈。吴毓于12月5日应约亲率中共瓯北县委组织部长徐顺性、武工队长潘统镛，以及武工队员陈继岳、谢寿金、潘行奎等六人，携带五支木壳枪和一支手枪，从中堡、小陈等地分头出发到黄山村，会同郑九芝、牟老法，于12月10日抵达小坑。而余汝苟等人出尔反尔，当吴毓等人抵达黄山村时，他就派人送来通知，表示拒绝会见。吴毓等人认为既然已经讲好了，来了，为什么拒绝会见？因而不顾对方欢迎不欢迎，就勉强地进去了。结果遭土匪余汝苟的暗算，吴毓等六人牺牲。吴毓牺牲，中共浙南特委江北办事处解体，中共瓯北县委与中共浙南特委的联系也中断。
年1月，国民党闽浙赣三省边区绥靖指挥部发出33年度第一期清剿工作计划大纲。指名剿灭西楠溪胡景瑊等“奸匪”，限定时间两个月。2月21日，曹集云率部包围屿北村，中共瓯北县委机关及主要地方干部都已转移，顽军扑空，汪瑞烈、汪吉人两人的家被抄。不久，国民党第十四督剿处从枫林移驻乐清虹桥。年4月，第十四督剿处撤消。
曹集云撤走之后，中共瓯北县委立即着手恢复、整顿工作，派人去与上级联系。7月，与中共浙南特委的联系恢复。
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